海洋モニタリングデータベースについて
概要
海洋モニタリングデータベースとは、
国立研究開発法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業CREST研究領域「海洋生物多様性および生態系の保全・再生に資する基盤技術の創出」
にて研究開発されたデータベースです。
本データベースには、本研究領域にて実施された下記の研究課題から、塩基配列データを中心とした研究成果が格納されています。
本データベースには、本研究領域にて実施された下記の研究課題から、塩基配列データを中心とした研究成果が格納されています。
研究課題
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五條堀チーム
- 課題名: Digital DNA chipによる生物多様性評価と環境予測法の開発(平成23年度~平成28年度)
- 研究代表者: 五條堀 孝(早稲田大学 ナノ・ライフ創新研究機構 招聘研究教授)
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木暮チーム
- 課題名: 超高速遺伝子解析時代の海洋生態系評価手法の創出(平成23年度~平成28年度)
- 研究代表者: 木暮 一啓(東京大学 大気海洋研究所 教授)
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竹山チーム
- 課題名: シングルセルゲノム情報に基づいた海洋難培養微生物メタオミックス解析による環境リスク数理モデルの構築(平成23年度~平成28年度)
- 研究代表者: 竹山 春子(早稲田大学 理工学術院 教授)
格納データについて
海洋モニタリングデータベースには、各チームの海洋メタゲノム研究にて得られた塩基配列データおよび関連情報(環境情報、各種手法など)が格納されています。
塩基配列登録件数
チーム | データ数 | 総リード数 | 総塩基数 |
---|---|---|---|
五條堀チーム | 458 | 4,580,346,103 | 684,554,766,184 |
木暮チーム | 304 | 735,598,532 | 76,264,230,808 |
竹山チーム | 115 | 1,367,094,954 | 314,087,482,694 |
合計 | 877 | 6,683,039,589 | 1,074,906,479,686 |
お問い合わせ先
marine-meta[アットマーク]maoi-i.jp